甲醛变性电泳
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实验原理
提取样品的总RNA后，一般根据RNA的凝胶电泳图来判断RNA的质量。由于RNA容易形成二级结构，因此常用甲醛变性胶来进行RNA电泳，得到的电泳图能真实反映RNA的质量状况。将RNA通过凝胶电泳使之在凝胶中分离出来，通过加入标准核酸分子（markers）对其进行鉴定，并用于转膜、杂交等。
实验试剂
1. DEPC 水的处理：用量筒量取去离子水2L，在通风橱中，加入2ml DEPC到2L去离子水中，终浓度为0.1%的DEPC。迅速盖上盖子，混匀，然后放在摇床中中速摇荡至少4hr，再高压灭菌。灭菌时将瓶盖松开，15磅灭菌20min。
2. 10×MOPS缓冲液（即10×FA缓冲液）： 500ml
0.2mol/L MOPS（3-〔N-吗啉〕丙磺酸）
80mmol/L NaAc
10mmol/L EDTANa2
先用400 ml DEPC水溶解20.6g MOPS和4.1gNaAc后，加入10ml 0.5mol/L EDTA，定容500ml。用0.22mm滤器过滤除菌，装入棕色瓶中，室温避光保存。
或0.2mol/L MOPS（3-〔N-吗啉〕丙磺酸）
50mmol/L NaAc
10mmol/L EDTA
用2mol/L氢氧化钠调节pH至7.0，临用时用DEPC水稀释。
3. 1×MOPS电泳缓冲液（即1×甲醛变性胶电泳缓冲液1×running buffer）：1500ml
10×MOPS 150ml
37%甲醛 80ml
加水至1500ml，一般在3次电泳结束后需更换此电泳缓冲液。
4. 5 × 甲醛变性胶加样缓冲液（5×loading buffer）： 10ml
预先配制水饱和的溴酚蓝溶液：在1.5ml 离心管中加入约0.1mg溴酚蓝，加入1ml DEPC水溶解，充分振荡溶解，离心，可见离心管底部有溴酚蓝粉末剩余，上层液体即水饱和的溴酚蓝液。在15ml灭菌离心管中，依次加入以下各种成分：
4.0ml 10 × FA buffer
3.1ml 甲酰胺
2.0ml 100%的甘油
720ul 37%的甲醛
80ul 0.5MEDTA （PH 8.0）
16ul 水饱和的溴酚蓝
100ul DEPC水
混匀，分装，-20℃保存，常用放4℃保存。
或 甲醛凝胶变性RNA电泳加样缓冲液（10×）： 10
50％甘油
1mmol/L EDTA
0.25％溴酚蓝
0.25％二甲苯氰
5ml甘油、20ul 0.5mol/L EDTA、25mg溴酚蓝、25mg二甲苯氰，加DEPC水至10ml，高压后，4°C保存。
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