生物燃料，泛指由生物质组成或萃取固体、液体或气体。所谓的生物质系指有机活体或者有机活体新陈代谢的产物，例如牛粪。不同于石油、煤炭、核能等传统燃料，这新兴的燃料是可再生燃料。
巴西乙醇汽油加油站
生物燃料其中一种定义是“至少80％的体积，由十年内生产的有机活体物质所提炼出的燃料。”如同煤炭与石油，生物燃料也是储存太阳能的燃料。太阳的能量经过植物光合作用的转化，以化学能的形式存于植物中。生物燃料其中一个优于大部分燃料的好处便是它可被生物分解，倘若不小心泼洒到自然环境，相较于其他燃料也较不容易造成环境污染。目前生物燃料最重要的意义是期望能减少二氧化碳排放。
诺奖得主哈特穆特-米歇尔：生物燃料没前途
马克斯-普朗克生物物理研究所的哈特穆特-米歇尔在《德国应用化学》（Angewandte Chemie）上发表了名为'The end of biofuels?的社论，仅标题就表明了他的态度：生物燃料是扯淡。他对所有生物燃料领域的研究者和支持者集体发难，而不仅针对成为现今研究大热门的玉米乙醇这一隅。米歇尔揭示了地球上最重要的蛋白质之一—光合成反应中心的结构，并因此获得了诺贝尔化学奖。在评论中，米歇尔先解释了生物燃料合成过程的能量效率。光合作用一直被人类膜拜，然而它并不如我们想象般高效。某种意义上讲，它的出现兼有进化的“合适开始”和历史的偶然性。一方面，植物因无法利用紫外、红外、绿色光而浪费了光谱中很大一部分能量。而电子转移及光捕获蛋白机制则很完美，并且在接下来的光反应和暗反应都有参与。光反应主要获取光能并产生辅酶NADPH和合成酶ATP，然后暗反应利用这部分能源和降低的电势与二氧化碳作用合成碳水化合物。但讲到能量利用固有低效问题，仅阳光光能的12%能被储存在NADPH中。详细报道
欧盟委员会：质疑传统生物燃料可持续性
欧盟委员会一份名为《欧盟交通温室气体排放：到2050年路线》的新报告草案指出：生物柴油等传统生物燃料会增加温室气体排放，而且造价昂贵，不适合作为替代燃料。该研究估计，不考虑间接影响，生物燃料的减排成本将达每吨二氧化碳100~300欧元。而当前二氧化碳的市场价格仅为6.14 欧元/吨，这意味着使用生物燃料减排的代价相当于购买排放权的49 倍。不仅如此，生物燃料还会带来毁灭森林、草地等间接影响，实际上增加了碳排放。详细报道
欧盟能源与气候行动部门：无力解决生物燃料上存在的争议
目前，欧盟能源与气候行动部门意见相持不下，气候行动部门认为必须将间接土地利用变化影响纳入评估范围，以便于确定生物燃料使用对环境影响的利弊程度，而能源部门则认为，在尚缺乏足够科学数据的情况下，将继续推动使用生物燃料。尽管欧委会巴罗佐主席试图推动两个部门达成妥协，但经过冗长的辩论之后，双方并未就此达成一致。环保组织称，让人高兴的是生物燃料间接影响需要认真对待似已成为欧盟委员们的共识，但让人失望的是进程如此缓慢，相关法律法规尚不得不等待数年。而一些生物燃料公司则称，有关间接土地使用变化增加气体排放的证据是不一致的。欧洲生物柴油委员会也表示，基于错误数据的立法建议会损害欧盟的能力，难以实现其2020年排放量减少20％的目标。详细报道
美国农业委员会：保留生物燃料项目融资
美国参议院农业委员会保留几个生物燃料项目资金，这项资金将用于农业部补助金和纤维素炼油厂贷款担保。该委员会召开会议综合审议农场法案，该法案最初是不支持这几个生物燃料项目。但经修订后公布的法案，恢复对这些生物燃料项目融资8亿美元。该修正法案将有助于逐渐削减美国石油进口，并创造就业机会。生物燃料提供美国燃料供应的10%。“这就发展下一代生物燃料如此重要的原因所在。”详细报道
生物燃料未来发展
未来可能利用藻类(例如海藻) 来生产生质柴油，以增加生质能源效率，和减轻生质能源可能对农产品价格的影响。 不过，技术上还需一些突破，而且于生产的藻类很可能是基因改造品种，因此预防这些藻类混入生态系统也是个课题。（生物谷Bioon.com）
