巴西Biocapital公司在Charqueada拥有生物柴油工厂，该工厂是许多生物柴油工厂中的第一批之一，巴西将采用植物油和/或动物脂肪生产生物柴油。生物柴油生产采用反酯化工艺，使三甘油酯的长脂肪酸链截短形成甲酯，甲酯生成生物柴油。过程采用2%甲醇钠(NaOCH3)为催化剂，甲醇为溶剂。反应30分钟后，粗的生物柴油从甲醇中分离出来，副产物甘油（1,2,3-丙三醇）来自三甘油酯的丙基主链，并得到其他剩余物。生物柴油由减压蒸馏提纯，得到最终产品。甘油副产物现已可生产丙二醇和环氧氯丙烷。
Biocapital公司的工厂现生产生物柴油能力为6万t/年，到2008年初该公司将使产量提高到25.2万t/年（7600万gal）。该公司计划成为一体化的生物燃料公司，同时生产生物柴油和生物乙醇。
巴西汽车已试用70%石油基柴油和30%生物柴油的B30柴油燃料。生物柴油由75%大豆油和25%蓖麻油生产。
巴西较多地依赖于柴油，柴油占巴西运输燃料市场58%。巴西现进口其柴油用量约15%，但将很快改变这一状况，法规规定，到2008年，巴西的柴油必须含有2%生物柴油，这表明，需要约2.1亿gal/年生物柴油，到2013年掺加量要求增大到5%，即约需6.35亿gal/年生物柴油。
相对比较，美国2006年生产生物柴油约2.5亿gal/年。据美国贸易委员会预测，到2015年美国生物柴油年生产量将增加到6.5亿gal/年。
巴西选用油类作物种籽生产生物柴油，包括大豆、棉籽、葵花籽、油菜籽、蓖麻籽、芝麻籽等。这些种籽每年每公顷约可产油0.5t。巴西的目标是在今后10年内每公顷产油2t，30年内每公顷产油5t。
现在，巴西96%的植物油来自大豆，约3%来自棕榈油，其余1%来自各种含油的种籽。
据称，来自引进的非洲棕榈和巴西本土棕榈的果实其含油量比大豆高出12倍。这些棕榈已在东南亚、非洲和巴西北方地区广泛种植，从棕榈生产的油的数量仅次于大豆油而居第二位。使用棕榈油生产生物柴油也面临一些技术挑战，如棕榈树需种植约5年才能结果。20年后棕榈树大量产油才能达到顶峰。由纯棕榈油生产的生物柴油，油的熔点高，这种生物柴油在世界上许多地方不能使用。
