由中国科学院北京基因组研究所胡松年研究员和中国科学院海洋研究所王广策研究员共同主持的“坛紫菜大规模测序和生物信息学分析”研究项目日前取得重大进展。
项目组选取我国特有的海藻栽培品种——坛紫菜作为研究对象,构建了其丝状孢子体cDNA文库,随机测序了11,000个克隆,获得了EST(表达序列标签)数据,其中有近4000条EST序列提交到了国际基因数据库(GenBank)。通过对坛紫菜EST数据库的生物信息学分析,发现了一些重要的基础代谢过程和独特的产物合成途径。
这是我国首次对海藻基因组进行的大规模测序。本项目的完成极大的丰富了海洋藻类基因信息数据库,为经济海藻分子育种学和海藻药物基因组学的研究奠定了雄厚的基础,标志着我国的海洋藻类基因组学研究进入了一个新的发展阶段。