基因芯片技术是90年代中期以来影响最为深远的重大科技进展之一，是融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术，具有重大的基础研究价值，又具有明显的产业化前景。作为芯片业界领头羊的Affymetrix芯片产品，以其卓越的品质，受到了广大科研工作者的青睐。自1993年以来，世界各地采用 Affymetrix GeneChip技术平台发表的论文高达2700多篇，其中包括《Science》45篇，《Nature》24篇，《Cell》16篇。最近，Affymetrix公司的 The GeneChip System 3000Dx (GCS 3000Dx)系统通过了欧盟CE认证，成为世界上第一套被批准用于临床诊断的芯片系统，同时由于芯片技术的独特优势和产品的卓越表现，Affymetrix公司在全球基因芯片生产厂家中第一家通过了ISO国际标准认证。
基因芯片技术特点
--- GeneChip 独特的原位光刻技术，定量分析、重复性好
--- GeneChip 独特的PM-MM探针专利设计，有效解决芯片非特异杂交问题，真正提高检测的灵敏度和特异性
--- GeneChip 表达谱芯片独特的每一个基因多段25mer探针设计，有效区分同源序列，极大提高检测的特异性和准确性
--- GeneChip Genotyping芯片对每个SNP位点进行40次独立的检测，保证检测的准确性
--- 单色荧光信号适于多张芯片结果的灵活比较，降低用户成本
--- 强大的网上数据分析功能，为后续功能研究提供有力保障
Affymetrix丰富的芯片种类
--- 表达谱芯片，应用于多种模式生物全基因组的表达谱研究
包括人、大鼠、小鼠、犬、斑马鱼、爪蟾、果蝇、疟原虫/按蚊、线虫、酵母、拟南芥、大麦、葡萄、大豆、大肠杆菌、绿脓杆菌、枯草杆菌、金葡球菌；水稻、小麦、鸡等20余种生物，是目前覆盖物种范围最全的基因芯片平台。
--- Genotyping芯片，应用于人类全基因组的单核苷酸多态性(SNP)研究
利用Affymetrix人类全基因组SNP芯片,仅需250ng起始DNA，一条引物，一次PCR反应便可获得10000 - 100000个SNP位点的信息。独特的芯片设计保证了99.96%的高重复性。
--- 测序芯片
Affymetrix推出一系列DNA测序芯片：为罗氏制药度身定做的CYP450药检芯片；用于肿瘤机制研究的人类线粒体编码区测序芯片；还开发出SARS测序芯片，18种病原体检测芯片，健康检测型芯片p53、HIV…
---客户定制芯片
根据用户实际需要，量身定做特殊用途的芯片，提交序列后60个工作日即可完成芯片的设计、制备和检测
--- 即将推出的全新概念芯片
Splicing Variants GeneChip：可变剪切子芯片，探究更真实的基因事件
Whole-transcriptome GeneChip：转录组芯片，真正做到全转录组研究
Affymetrix基因芯片操作平台——1套系统，便可完成多物种的表达谱分析、人类SNP分析、高通量测序分析
---专用芯片杂交箱 Hybridization Oven 640
---全自动洗涤工作站 Fluidics Station 450
---高分辨率芯片分析检测系统（GeneChip Scanner 3000）
Affymetrix配套软件
GeneChip® Operating Software (GCOS)，Version 1.2 ——实现完全的仪器控制、准确的数据分析和完整的数据管理功能。
Affymetrix Data Mining Tool(DMT)，Version 3.0 ——GCOS 获得数据之后，交给DMT，为表达谱芯片提供高级数据分析
Affymetrix GeneChip DNA Analysis Software(GDAS)，Version 3.0 ——GCOS获得数据之后，交给GDAS，为测序芯片，SNP芯片提供高级数据分析
Avadis（Strand Genomics公司生产，表达谱高级数据分析软件）
提供动态交互的可视操作界面，可同时打开并观察多个数据
提供多种统计学检验工具: paired and unpaired T-test, Mann-Whitney tests, One-way and two-way ANOVA, Repeated Measures tests, and PCA.
多种公认的聚类分析方法：k-means clustering, Hierarchical, Self-organizing maps, Random Walk, and more
建立多种图形：2D和3D散点图，直方图，信号通路图，功能分类图
提供多种注释信息： GO browser, PubMed Correlation Matrix and Pathway viewer.
